Վարչապետ Նիկոլ Փաշինյանի որոշմամբ՝ Կարեն Գիլոյանը նշանակվել է նշանակվել է կրթության, գիտության, մշակույթի և սպորտի նախարարի տեղակալ:
Գիլոյանը 2000 թվականից Հայաստանի դարթսի ֆեդերացիայի հիմնադիր նախագահն է։ 1996 թվականից աշխատում է Հայաստանի hանրային hեռուստաընկերությզն «Սպորտ» ստուդիայում՝ որպես լրագրող և մեկնաբան։